Artificial Matalloproteins Project
Department of Inorganic and Analytical Chemistry
Bioinorganic Chemistry Research Group
2023. May
Bálint Hajdu successfully defended his doctoral dissertation entitled "Cinkujj fehérjék fémion-, és DNS-kötésének vizsgálata, módosításuk Ni(II)-indukált peptidhidrolízis segítségével" on May 12. Congratulations!!!
2023. May
Attila Jancsó participated as a mentor in the European Olympiad of Experimental Science (EOES) held between April 29 and May 6 in Riga.
2023. April
Our latest article just got accepted in the Journal of Inorganic Chemistry .
2023. April
The Chemistry and Chemical Industry section of the National Conference for Student Research (OTDK) took place between April 12-15, where five of our enthusiastic students presented their research results
Bettina Fazekas: "Cinkujj fehérje-DNS kölcsönhatások vizsgálata sejten belül" (2nd place)
József Buránszki: "Cinkujj-ATCUN mesterséges nukleázok optimalizálása" (special award)
Máté Levente Kis: "Fémionok versen-gése a monenzin A fémkötő helyeiért"
Melinda Horvát: "Cinkujj fehérjéket kódoló DNS szekvenciák tervezése sejteken belüli fehérje-DNS kölcsönhatás tanulmányozása céljából"
Viktória Egyed: "Fémionok hatása a TEM-1 β-laktamáz enzimre"
Congratulations!!!
2023. February
Our article on the interaction of zinc finger proteins with Zn(II) and DNA was published in the Journal of Biological Inorganic Chemistry.
2023. January
Our latest article just got accepted in Inorganics.
2022. December
Our latest article just got accepted in Molecules.
2022. November
Attila Jancsó, travelled to Japan, where he gave a lecture at the 10th AsBIC conference in Kobe between Nov 28 and Dec 3 entitled: "On the Possible Roles of the C-Terminal CCHHRAG Fragment of the Metalloregulatory Protein CueR in the Selection of Cognate Metal Ions".
2022. November
The annual Scientific Students’ Associations Conference was held on November 24 and our research group was represented in the largest number so far.
Five of our enthusiastic students presented their research results and each of them have the chance to present in the National Scientific Students’ Associations Conference as well.
(For the detailed program click here).
Bettina Fazekas: "Cinkujj fehérje-DNS kölcsönhatások vizsgálata sejten belül" (2nd place)
József Buránszki: "Cinkujj-ATCUN mesterséges nukleázok optimalizálása" (2nd place)
Máté Levente Kis: "Fémionok versen-gése a monenzin A fémkötő helyeiért" (2nd place)
Melinda Horvát: "Cinkujj fehérjéket kódoló DNS szekvenciák tervezése sejteken belüli fehérje-DNS kölcsönhatás tanulmányozása céljából" (1st place)
Viktória Egyed: "Fémionok hatása a TEM-1 β-laktamáz enzimre" (2nd place)
Congratulations!!!
2022. November
Zeyad H. Nafaee participated in the 28th International Symposium on Analytical and Environmental Problems (28th ISAEP) which was held online, between 14th -15th of November. He presented the our latest Mass Spectrometric results aout the TEM-1 β-lactamase: “Interaction of TEM-1 β-lactamase with Ni(II) ions – Mass Spectrometry”
2022. October
Zeyad H. Nafaee presented a lecture entitled: “Effect of metal ions Ni(II), Cd(II), and Hg(II) on TEM-1 β-lactamase” in the 45th. Chemistry Lectures (XLV. KEN), which was organized in Szeged between 25th - 27th of October.
2022. October
Bálint Hajdu participated in the 16th Pro scientia gold medalist conference (PSAK XVI.) in Szeged between October 13-15, where he held a lecture entitled: “Mesterséges cinkujj fehérje kölcsönhatása toxikus fémionokkal”.At the conference, many fields of science were represented in mixed sections (artists, musicians, historians, lawyers, engineers, doctors, natural scientists...), so it was possible to get a better insight into the research going on in each field.
2022. September
Between September 21 and October 6, Prof. Béla Gyurcsik travelled to Japan to the University of Tsukuba to discuss with Prof. Atsushi Kawaguchi, Prof. Kohsuke Kato and Prof. Kyosuke Nagata the latest results of the cooperation between our research groups and the future perspectives. In the meantime, he also conducted research.2022. September
Zeyad H. Nafaee participated the MOSBRI End User Short Course (ESC3) about Quality control for Integral Membrane Proteins from 12-14, September at EMBL (c/o DESY), Hamburg, Germany.This course was organized was by Maria Garcia Alai. Tutorial lectures were Inga Hänelt, Misha Kudryashev, and Christian Löw., while the practical session tutors were Stephan Niebling, Osvaldo Burastero, Angelica Struve, Katharina Veith. Instrument demonstrations and practical sessions covered Nano- differential scanning fluorimetry (NanoDSF), Mass Photometry (MP) and Dynamic Light Scattering (DLS) AND Electron microscopy (EM) preparation.
2022. September
Our latest article just got accepted in the Protein Expression and Purification Journal
2022. August
Annamária Tóth and Attila Jancsó visited the laboratory of the European Organization for Nuclear Research (CERN) in Geneva between August 21 and 31 and performed 199mHg perturbed γ-γ-angular correlation (PAC) spectroscopic measurements.
2022.July
The 16th EuroBIC international conference was held between July 17 and 21 in Grenoble, where our group participated with oral lectures and posters as well:Annamária Tóth: As(III) and Hg(II) interaction of an oligopeptide modelling the metal binding site of the metalloregulatory protein AfArsR (poster presentation)
Bálint Hajdu: Interaction of a Cys2His2 zinc finger protein with toxic metal ions (poster presentation)
Attila Jancsó: On the metal site stabilizing role of the C-terminal CCHHRAG fragment of the metalloregulatory protein CueR (oral lecture)
Béla Gyurcsik: Interplay of multiple metal ion binding sites regulates the catalytic activity of metalloenzymes (oral lecture)
2022. July
Zeyad Hasan Nafaee 3rd year PhD student, traveled to Japan, where he gave a lecture at the 8th ISM conference in Kanazawa between July 11 and 14, and then conducted research in the laboratory of Professor Atsushi Kawaguchi between July 15 and 24 at the University of Tsukuba.
2022. June
Our latest article has been accepted in the journal ChemBioChem.
2022. June
The first MOSBRI scientific conference was held at the Pasteur Institute in Paris, focusing on the study of systems between atoms and cells. Our group was represented by Bálint Hajdu with his poster "Interaction of an artificial zinc finger protein with toxic metal ions".
2022. June
Béla Gyurcsik gave a presentation at the XXVIII. International Conference on Coordination and Bioinorganic Chemistry (ICCBIC) entitled: Metal ions as regulators of hydrolytic enzymes.
2022. May
The 55th Colloquium on Complex Chemistry(55th KKK) took place in Debrecen berween 25-27 May.The following lectures were given by our group members: Béla Gyurcsik "Fémkötő helyek fehérjékben", Attila Jancsó "A CueR fémszabályzó fehérje C-terminális CCHHRAG fragmensének szerepe a fémionkötőhely stabilizálásában", Annamária Tóth "Az As(III) és Hg(II) kölcsönhatása az AfArsR fémszabályzó fehérje félfémkötő szakaszát modellező oligopeptiddel"
2022. April
Bálint Hajdu PhD student spent 2 months at the laboratory of Professor Atsushi Kawaguchi at the University of Tsukuba.2022. March
Our latest article just got accepted in the Journal of Inorganic Biochemistry.
2022. January
Our latest article just got accepted in Angewandte Chemie International Edition.
2021. December
Bálint Hajdu participated in the Workshop on Structural Biophysics in Bordeaux from 5 to 10 December 2021. During the workshop, the participants could learn about the methods suitable for the examination of macromolecules (AFM, Cryo-EM, X-ray, NMR, EPR, MS, IR, Raman Spectroscopy) in theory and practice. In addition, the poster sections provided an opportunity to learn about each other's research.
2021. November
Zeyad Nafaee participated the MOSBRI End User Short Course (ESC1) about Circular Dichroism (CD) spectroscopy from 3rd to 5th of Nov 2021 at Aarhus University, Denmark. The course was hosted by Søren Vrønning Hoffmann, and Nykola C. Jones, and covered several topics about CD spectroscopy instrumentation, buffer limitations, troubleshooting, protein secondary structure calculations, non-protein CD studies.
2021. July
The 35th Anniversary Symposium organised by the Protein Society was held online between 7 and 14 of July.Zeyad Nafaee: Purification and Characterization of NFI-BD. (poster)
Bálint Hajdu: Metal binding of a potential zinc finger nuclease. (poster)
2021. May
Two students from our laboratory: Gyula Albeck and Máté Lenevte Kis presented their lectures during the XXXV. National Scientific Students' Associations Conference which was held online between 17-19 May. Máté Levente Kis achieved a special award for his presentation. The supervisiors of the students were Béla Gyurcsik and Bálint Hajdu.
2020. November
The annual Scientific Students’ Associations Conference was held on November 26th. Two students from our research group presented their results: Gyula Albeck won the 2nd and Levente Máté Kis the 3rd place. Furthermore they both have the chance to present in the National Scientific Students’ Associations Conference. Congratulations on the results!2020. September
On the Hungarian Higher Education Day, Béla Gyurcsik was awarded a Ministerial Certificate of Recognition for his outstanding teaching and research activities! In the name of all group members congratulations!2020. August
Abd Elhameed Heba Alaa Eldeen Hosiny successfully defended her doctoral dissertation entitled "Artificial metallonucleases - molecular tools for gene therapy of cancer". Congratulations!!!
2020. May
Balogh Ria Katalin successfully defended her doctoral dissertation entitled "Transcriptional Activator CueR Protein: Purification, Characterization and Potential Bioanalytical Application". Congratulations!!!2020. May
Our latest article just got accepted in the Journal of Macromolecular Bioscience.
2020. February
The last conference of the COST Arbre-Mobieu action was held in Prague from 24 to 26 February. Béla Gyurcsik, Heba Elhameed and Bálint Hajdu participared in the conference.Heba Elhameed: 6×HIS TAG MODULATES THE CATALYTIC ACTIVITY OF NCOLE7 NUCLEASE (poster)
Hajdu Bálint: NOVEL ZINC FINGER-BASED ARTIFICAL NUCLEASES (oral presentation)
2020. February
Two of our articles were published this month:
2019. október
2019. október 31-én a Magyar Tudományos Akadémia Dísztermében átadták a Pro Scientia és Mestertanár Aranyérmeket. Csoportunk PhD hallgatóját, Hajdu Bálintot Pro Scientia Aranyéremmel tüntették ki.2019. augusztus
A svájci Interlaken városában került megrendezésre a 19. International Conference on Biological Inorganic Chemistry nemzetközi konferencia. A rendezvényen csoportunkat Balogh Ria Katalin és Hajdu Bálint képviselte.Balogh Ria Katalin: Investigation of Hg(II) Binding of CueR Protein: A Possible Role of C-Terminal Cysteines in Selective Operation of the Protein (poszter)
Hajdu Bálint: Applications of Ni(II)-induced peptide bond cleavage. (poszter)
2019. július
Elfogadták legújabb cikkünk a Chemistry: A European Journal folyóiratban.
2019. július
Heba Elhameed részt vett a 2nd International Conference “Plant Genome Editing & Genome Engineering” konferencián Bécsben, ahol egy poszter formájában mutatta be eredményeit: Artificial nucleases-Molecular tools for gene therapy.2019. június
Június 11-14. közt , International Symposium on Metal Complexes konferenciának Debrecen adott otthont.Heba Elhameed: Metal ions as regulatory elements of artificial nucleases. (előadás)
Gyurcsik Béla: Modulation of catalytic activity of the NColE7 metallonuclease. (poszter)
Jancsó Attila: Recognition of the proper metal ion: how does the metalloregulatory protein CueR discriminate metal ions with similar coordination properties? (előadás)
2019. június
A 15th International Symposium on Applied Bioinorganic Chemistry konferencia június 2 és 5 között került megrendezésre az őzek városában, Narában. Legújabb eredményeinket "Metal ions as regulatory elements of artificial DNA cleaving enzymes" című előadásában mutatta be Gyurcsik Béla2019. június
Az MKE Vegyészkonferencián Hermann Enikő mutatta be legújabb kutatási eredményeit: A C45-ZF-N85 összetett cinkujj-nukleáz és mutánsainak előállítása és vizsgálata.2019. május
A 2 évente megrendezésre kerülő Smolenicei XXVII. International Conference on Coordination and Bioinorganic Chemistry konferencián Hermann Enikő tartott előadást: Purification and characterization of the C45-ZF-N85 artificial zinc-finger nuclease and its mutants.2019. május
2019. május 21-23. között zajlott Velencén az 53. Komplexkémiai Kollokvium. Csoportunkból Gyurcsik Béla a Fémionok Által szabályozott mesterséges nukleázokról, míg Hajdu Bálint Fémtartalmú fehérje alapú nukelázok DNS specifitásáról tartott előadást.2019. március
Elfogadták legújabb cikkünk a Protein expression and purification folyóiratban.
2019. március
Kutatócsoportunk hallgatói ismét sikeresen szerepeltek az XXXIV. OTDK Kémiai és Vegyipari Szekciójában, amelyet a BME rendezett 2019. március 21-23. között Budapesten. Hermann Enikő Különdíjazott lett, és lehetőséget kapott rá, hogy részt vehessen a Vegyészkonferencián, Hajdu Bálint első helyezést ért el. Mindkettőjük témavezetője Gyurcsik Béla.
2019. március
A 2019-es konferencia szezont a Zágrábban rendezett ARBRE-MOBIEU Molecular Biophysics: ABC of the puzzle of Life rendezvény nyitotta meg, amelyen két kutatónk vett részt.Heba Elhameed: Intramolecular allosteric control of NColE7 metallonuclease based on the specific protease action of nickel(II) ions (poszter)
Gyurcsik Béla: Detection of toxic metal ions by the CueR metalloregulator (poszter)
2019. február
Elfogadták legújabb cikkünk a European Biophysics Journal folyóiratban.
2019. február
Hermann Enikő MSc hallgatónk 1 hónapot töltött A national Institute of Chemistry kutatóintézetben Szlovéniában, ahol a korábban molekuladinamikai szimulációk segítségével vizsgált fehérjék nagy mennyiségű kifejezésével foglalkozott.2018. december
Hajdu Bálint első éves PhD hallgatónk 3 hónapot töltött a Tsukubai Egyetemen Kyosuke Nagata professzor laboratóriumában.2018. szeptember
Hermann Enikő MSc hallgatónk 3 hónapot töltött Bécsben egy Campus Mundi szakmai gyakorlat keretében, ahol a legújabb generációs mesterséges metallonukleázaink optimalizálásán dolgozott molekuladinamikai számolások segítségével.2018. augusztus
Szintén augusztusban került sor a 14. EuroBIC nemzetközi konferenciára, Birminghamben:Balogh Ria Katalin: Detection of toxic metal ions by using the CueR metalloregulator (poszter)
Gyurcsik Béla: Multiple allosteric control in novel zinc finger-based artificial nucleases (poszter)
Jancsó Attila: Oligopeptide models of cysteine-rich Cu(I)- and Hg(II)-binding metal sites of metalloproteins (poszter)
2018. augusztus
A Visegrad Fund által finanszírozott "Algal cell biophysical properties as markers for enviromental stress in aquatic systems" workshop keretében csoportunk Zágrábba látogatott. Ennek célja, hogy megvitassuk együttműködő partnereinkkel a toxikus fémionok tengeri algákra gyakorolt hatását vizsgáló kutatásunk legújabb eredményeit. Balogh Ria Katalin az AFM méréseket ismertette, Hajdu Bálint az algák fehérjeprofiljának változását mutatta be, míg Gyurcsik Béla azon fehérjék ESI-MS vizsgálatát ismertette, melyek felelősek lehetnek a toxikus fémionok eltávolításáért.2018. július
A 43. International Conference on Coordination Chemistry rendezvényen, amelyre Sendai-ban került sor Gyurcsik Béla mutatta be csoportunk legújabb eredményeit "Development of novel zinc finger-based artificial nucleases" című előadásában.2018. június
Elfogadták legújabb cikkünk a Metallomics folyóiratban.
2018. június
Csoportunk 4 tagja vett részt a Firenzében megrendezett International Symposium on Metal Complexes konferencián.Gyurcsik Béla: Design and investigation of novel zinc finger–NColE7-based artificial nucleases (előadás)
Hermann Enikő: Expression and purification of Cx-ZF-Ny NColE7-based zinc-finger nucleases (poszter)
Fábián Zita: Affinity protein purification resulting in protein sequence without remaining amino acid residues (poszter)
Hajdu Bálint: Mixed-ligand metal complexes of fluorosalicylic acids and 2,6-pyridindimetanol (poszter)
2018. május
Az 52. Komplexkémiai Kollokviumra 2018. május 22- 24. között került sor a Balatonvilágosi Akadémiai Üdülőben. A 3 napos konferencián csoportunk tagjai által megtartott előadások:Hajdu Bálint: Kismolekulák és fehérjék kölcsönhatása DNS-sel fémionok jelenlétében
Fábián Zita: N-terminális NcolE7 metallonukleáz mutánsok DNS komplexeinek szerkezete- röntgenkrisztallográfiai vizsgálatok
Hermann Enikő: NColE7 és C127 fehérjék szerkezetének NMR spektroszkópiás vizsgálata
Mesterházy Edit: Cu(I)ionok hatékony megkötésére alkalmas β-turn motívumot és két ciszteint tartalmazó tetrapeptid
Jancsó Attila: Metalloproteinek cisztein-gazdag Cu(I)- és Hg(II)-kötőhelyeit utánzó oligopeptidek
2018. április
A Biotech-2018 nemzetközi konferencián (április 25-27.) Heba Elhameed képviselte csoportunkat "Affinity Protein Purification Resulting in Protein Sequence without Remaining Amino Acid Residues" című poszterével, amelyért elnyerte a legjobb poszter díjat, gratulálunk!2018. március
Március 19-21. közt tartották az ARBRE-Mobieu Warsói plenáris találkozóját, és csoportunk poszter prezentációkkal volt jelen.Balogh Ria Katalin: AFM study of the protein DNA interactions effect of mutations and metal ion binding of the proteins on DNA structure
Gyurcsik Béla: Intrinsic protein disorder could be overlooked in cocrystallization conditions: and srcd case study
Heba Abs Elhameed: Affinity protein purification resulting in protein sequence without remaining amino acid residues
2018. február
Elfogadták legújabb cikkünk a Chempluschem folyóiratban.
2018. január
Elfogadták legújabb cikkünk a Chembiochem folyóiratban.
2017. október
2017. októberében került megrendezésre a XL. Kémiai Előadói Napok Szegeden.Hermann Enikő: Az N-terminális aminosavak lehetséges szerépenek megismerése az NColE7 metallonukleázban (előadás)
Hajdu Bálint: Cinkujj fehérjék átalakítása mesterséges metallonukleázokká Ni(II) ionok segítségével
2017. június
Június 7-10. között zajlott a 14th International Conference on Applied Bioinorganic Chemistry Touluose-ban, Franciaországban, ahol csoportunk is részt vett:Jancsó Attila: Synergistic effects observed in the AsIII-binding of small ligands possessing multiple thiol groups (előadás)
Szekeres Levente István: AsIII-binding of a peptide bearing two cysteine residues (poszter)
Mesterházy Edit: An Efficient Peptidic Copper(I) Chelator with Two Cysteines Linked by a Strong Turn (poszter)
Balogh Ria Katalin: A study on the secondary structure of the metalloregulatory protein CueR: effect of pH, metal ions and DNA
2017. május
Az 51. Komplexkémiai Kollokviumra 2017. május 29- 31. között került sor a Balatonvilágosi Akadémiai Üdülőben. A 3 napos konferencián csoportunk tagjai által megtartott előadások:Balogh Ria Katalin: Egy transzkripciós aktivátor fehérje pH-indukált szerkezetváltozásának tanulmányozása
Szekeres Levente István: Egy CXXC motívumot tartalmazó hexapeptid kölcsönhatása arzénessavval
Hajdu Bálint: Metallonukleázok kialakítása cinkujj fehérjék Ni(II)-indukált hasításán keresztül
2017. május
Csoportunk tagjai részt vettek a XXVI. International Conference on Coordination and Bioinorganic Chemistry konferencián.Gyurcsik Béla: Studying protein interactions through their metal ion binding properties by CD spectroscopy (előadás)
Zita Fábián: Structural activation of NColE7-based artificial metallonucleases
2017. március
A XXXIII. Országos Tudományos Diákköri Konferencia Kémiai és Vegyipari szekcióját idén Miskolcon rendezték meg. Az eseményen Csoportunk hallgatói Fábián Zita, valamint Hajdu Bálint első helyezést értek el. Mindkettőjük témavezetője Gyurcsik Béla.2017. március
Szekeres Levente István részt vett az ARBRE-MOBIEU Boilding Bridges in Biophysics konferencián Portóban, ahol az elábbi posztert mutatta be: SRCD in understanding the allosteric effect and metal binding in artificial metalloenzymes and metalloproteins2016. október
2016. október 17-19. között került megrendezésre a XXXIX. Kémiai Előadói Napok Szegeden, ahol Balogh Ria Katalin képviselte csoportunkat "A CueR fehérje másodlagos szerkezetének vizsgálata cirkuláris dikroizmus spektroszkópiával" című előadásával.2016. augusztus
Balogh Ria Katalin részt vett a 13th Greta Pifat Mrzljak International School of Biophysics nyári iskolában, Horvátországban, ahol az alábbi előadást mutatta be: Characterization CueR metalloregulatory protein and its interaction with „soft” metal ions2016. augusztus
2016 augusztusában került megrendezésre Budapesten a 13. European Biological Inorganic Chemistry Conference EuroBIC, ahol csoportunk számos tagja képviseltette magát.Gyurcsik Béla: Control mechanisms in zinc finger-based artificial nucleases
Jancsó Attila: Metal ion selectivity of the metalloregulator CueR approached via studies on oligopeptide probes
Szekeres Levente István: New insights into the interaction of As(III) with mono- and dithiols and their mixtures
Balogh Ria Katalin: Strategies for Purification of a Cystein Containing DNA Binding Protein
Mesterházy Edit: New Peptidic Cu(I) Chelators as Potential Candidates for the Treatment of Wilson’s Disease
Hajdu Bálint: Turning designed zinc finger proteins into artificial nucleases
2016. június
Hajdu Bálint összesen egy hónapot töltött a Lengyel Tudományos Akadémia varsói Biokémia és Biofizika intézetében Wojciech Bal laboratóriumában, ahol az 1MEY és 1MEY# cinkujj fehérjék Ni(II)-indukált hidrolízisét vizsgálta ESI-tömegspektrometriával.2016. június
Az International Symposium on Metal Complexes (ISMEC) június 7- és 10. között került megrendezésre Barcelonában. Csoportunkat Németh Eszter és Gyurcsik Béla képviselte "Studies on mutants of Colicin E7 metallonuclease - Crystal structures vs. aqueous solution" című előadásával.2016. május
Szunyogh Dániel május 17-én sikeresen megvédte „A réz-efflux szabályzó CueR fehérje fémkötő sajátságainak tanulmányozása modellpeptideken keresztül” című doktori disszertációját. Gratulálunk!2016. május
Az 50. Komplexkémiai Kollokviumra 2016. május 30-június 1. között került sor a Balatonvilágosi Akadémiai Üdülőben. A 3 napos konferencián 71 résztvevő összesen 46 előadást hallgathatott meg. Csoportunk tagjai által megtartott előadások:Mesterházy Edit: A Wilson betegség kezelésére potenciálisan alkalmas Cu(I) kelátorok.
Szekeres Levente István: Új eredmények az arzénessav-tiolát kölcsönhatásban.
Gyurcsik Béla: Cinkujj-alapú mesterséges metallonukleázok szabályozásának lehetőségei.
Fábián Zita: Cinkujj-alapú mesterséges metallonukleázok funkcionális szerkezete.
2016. március
Legújabb cikkünk olvasható a Protein Expression and Purification folyóiratban.
2015. november
A Bulletin of the Chemical Society of Japan című folyóiratban megjelent legújabb közleményünk.
2015. október
Megjelent egy újabb közleményünk az Angewandte Chemie folyóiratban.
2015. augusztus
Az MKE 2. Nemzeti Konferencia 2015. augusztus 31. – szeptember 2. között került megrendezésre Hajdúszoboszlón, ahol csoportunk két tagja is tartott előadást:Gyurcsik Béla: Fehérjealapú mesterséges metallonukeázok szabályozási lehetőségeiSzekeres Levente I.: Toxikus fémionok analitikai célú kimutatására tervezett cisztein tartalmú oligopeptid oldatfázisú vizsgálata2015. július
Mesterházy Edit egy Campus Hungary pályázat jóvoltából 4 hetet töltött Japánban. Együttműködő partnerünk, Kyosuke Nagata Tsukubai Egyetemen működő laborjába látogatott el, ahol Balogh Ria által korábban elkezdett projektet folytatta. Ennek célja a CueR szabályzó fehérje fémkötő tulajdonságait és nagyfokú érzékenységét kihasználva, fémionok detektálására és megkötésére alkalmas baktériumok kialakítása volt. Munkájában nagy segítségre volt kutatócsoportunk korábbi tagja, Németh Eszter, aki jelenleg is kétéves postdoc ösztöndíját tölti Japánban.2015. július
Hajdu Bálint egy hónapot töltött a Lengyel Tudományos Akadémia varsói Biokémia és Biofizika intézetében Wojciech Bal laboratóriumában, ahol az 1MEY és 1MEY# cinkujj fehérjék Ni(II)-indukált hidrolízisét vizsgálta és ennek hatását a fehérjék másodlagos szerkezetére.2015. június
Csoportunk tagjai részt vettek a XXV. International Conference on Coordination and Bioinorganic Chemistry konferencián, ami egyben az ICCBIC 50-ik évfordulója is volt, Smolenice-ben, Szlovákiában.Gyurcsik Béla: New generation of chimeric nucleases based on colicin E7 nuclease domain (előadás)
Hajdu Bálint: A possible method of gene editing using Ni(II)-induced zinc finger nucleases (előadás)
Balogh Ria Katalin: The potential application of CueR protein in selective detection of toxic metal ions (előadás)
2015. június
Csoportunk tagjai részt vettek az WE-Heraeus-Seminar on Synchrotron Radiation. Circular Dichroism (SRCD) spectroscopy konferencián Bad Honnefben, Németországban.Gyurcsik Béla: SRCD studies on metal ion binding of oligopeptides
Balogh Ria Katalin: Induced Folding of NColE7 Metallonuclease Monitored by SRCD
2015. május
A 49. Komplexkémiai Kollokviumra 2015. május 26 – 28 között került sor a Siófoki Akadémiai Üdülőben. A három napos konferencián 50 résztvevő összesen 30 előadást hallgathatott meg. Csoportunk tagjai által megtartott előadások:Szunyogh Dániel: A CueR fehérje fémkötő helyét modellező peptidek kölcsönhatása egy-, és kétértékű átmeneti fémionokkal.
Gyurcsik Béla: Fehérjék és modelljeik fémkomplexei – mesterséges „bio”-molekulák. (tervezett MTA doktori anyag előzetes bemutatása)
Jancsó Attila: Peptidek, mint potenciális receptor molekulák fémionok érzékelésére.
2015. május
Egy újabb publikáció elfogadására került sor.
2015. április
A Veszprémben, a Pannon Egyetem Mérnöki Karán megrendezett XXXII. Országos Tudományos Diákköri Konferencia Kémiai és Vegyipari Szekciójában mindkét hallgatónk helyezést ért el: Bálint Sára - Bioszervetlen kémia szekció - I. helyezésBalogh Ria Katalin - Biokémia, biotechnológia III. szekció - III. helyezés2015.február
Szunyogh Dániel két hetet töltött a Koppenhágai Egyetemen, Lars Hemmingsen laboratóriumában, ahol a V. Cholerae baktérium által termelt CueR fémionszabályzó fehérje fémkötő szakaszát modellező peptid Ag(I) komplexét vizsgálta NMR és CD spektroszkópiával.2014. december
Hajdu Bálint egy hetet töltött a Lengyel Tudományos Akadémia varsói Biokémia és Biofizika intézetében Wojciech Bal laboratóriumában, ahol mesterséges cinkujjfehérjék másodlagos szerkezetét tanulmányozta CD spektroszkópiával.2014. november
Németh Eszter November 10-én sikeresen megvédte REDESIGN OF THE COLICIN E7 NUCLEASE DOMAIN INTO A CONTROLLED AND SPECIFIC ARTIFICIAL ENZYME című doktori disszertációját. A védést követően Japánba utazott, ahol egy JSPS posztdoktori ösztöndíj jóvoltából 2016 novemberéig a Tsukubai Egyetemen, Prof. Kyosuke Nagata laboratóriumában dolgozik. Itt folytatja a mesterséges nukleázok tervezését és tesztelését szoros együttműködésben a szegedi csoportunkkal. Emellett bekapcsolódott a "kromatin csoport" munkájába, ahol DNS javító mechanizmusokat tanulmányoz rákos sejtvonalakon.2014. november
Megrendezésre került a Helyi Tudományos Diákköri Konferencia őszi fordulója, ahol két hallgató mutatta be pályamunkáját: Bálint Sára: Toxikus fémionok analitikai célú kimutatására tervezett cisztein tartalmú oligopeptid kölcsönhatása higany(II)ionokkal - I. helyezés Balogh Ria Katalin: Egy transzkripciós aktivátor fehérje lehetséges alkalmazása toxikus fémionok szelektív2014. október
Balogh Ria Campus Hungary Ösztöndíj jóvoltából 2 hónapot töltött a Dán Műszaki Egyetemen (DTU, Lyngby), Hans E. M. Christensen laboratóriumában, ahol a CueR fehérje kromatográfiás tisztításán dolgozott.2014. szeptember
Legújabb közleményünk már online elérhető a Metallomics folyóiratban.
2014. augusztus
Balogh Ria két hetet töltött Japánban, a Tsukubai Egyetem Nyári Iskolájában (Summer Reserach Program in Tsukuba). A két hét során Kyosuke Nagata Laborjában dolgozott a CueR fehérje által szabályzott, Cu(I)-ionok kimutatására alklamas módosított baktériumok előállításán és vizsgálatán. A kutatói munka mellett részt vett az előadásokon, ahol a prezentációk készítéséről és bemutatásáról kapott hasznos tanácsokat, majd a tanultakat gyakorlatba átültetve az utolsó napon bemutatta eredményeit a kar hallgatóinak és oktatóinak. A szakmai programok között lehetősége volt a japán kultúra megismerésére is, többek között tokiói városnézés, Tsukuba hegy megmászása, főzőverseny és játékos vetélkedő során.
2014. július
Megjelent egy közleményünk a Protein Science folyóiratban.
2014. július
Mesterséges metallonukleázok számítógépes tervezéséről publikáltunk egy cikket a Journal of Computer- Aided Molecular Design folyóiratban.
2014. június
Németh Eszter egy hónapot töltött Koppenhágában, ahol egy mutáns NColE7 NColE7 DNS-sel együtt történő kristályosításán és szerkezetének megfejtésén dolgozott. A kristályok közül néhányat cinkion-oldatba mártottak fagyasztás előtt, így lehetséges volt a fémiont kötő fehérje DNS-sel alkotott komplexének tanulmányozására is. 2014. február
Schilli Gabriella egy hónapos rövid tanulmányúton vesz részt sikeres Campus Hungary pályázatának köszönhetően. A prágai IOCB intézetben végez ITC-méréseket, melyekkel a korbban előállított fehérjék fémkötését tanulmányozza.2013. december
Szunyogh Dániel három hónapot töltött Dániában, a Campus Hungary pályázat keretében. Kutatómunkája az E. coli baktériumok CueR fehérjéjéhez kapcsolódott. NMR és más oldatszerkezeti vizsgáló módszerek segítségével tanulmányozta a fehérje fémkötő doménjét. 2013. szeptember
Gyurcsik Béla három hónapot tölt Japánban, a Tsukubai Egyetemen, Kyosuke Nagata laboratóriumában.2013. augusztus
Csoportunk több tagja is részt vett az Olaszországban, Triesztben megrendezett Chemistry Towards Biology konferencián. Czene Anikó (poszter): Crystal structure of an N-terminally truncated mutant of colicin E7 nuclease domain Gyurcsik Béla (előadás): Nuclease domain of colicin E7 as a potential platform for artificial metallonucleases Németh Eszter (előadás): Fine tuning of the catalytic activity by the positively charged residues at the N- terminus of the ColE7 nuclease Zóka István (poszter): Synthesis of artificial zinc finger proteins and their interaction with DNA 2013. július
Gyurcsik Béla 2013. július 1-től docensi kinevezést kapott. Az elismerést a Szegedi Tudományegyetem rektora, Szabó Gábor akadémikus adta át 2013. július 8-án, 10 órától a Szegedi Tudományegyetem központi épületében.2013. június
Czene Anikó sikeresen megvédte PhD dolgozatát június 28-án. Disszertációjának címe: A Colicin E7 nukleáz domén, mint egy lehetséges mesterséges metallonukleáz.2013. június
Csipak Brigitta MSc hallgató a Campus Hungary pályázatának köszönhetően egy hónapot tölt Lengyelországban, a varsói Biokémia és Biofizika Intézetben. A Zóka István által Japánban előállított cinkujjfehérje fémionok hatására bekövetkező hidrolízisét tanulmányozza. Emellett peptidhidrolízis vizsgálatával is foglalkozik.2013. május
A prágai IOCB intézetben, Lubomir Rulisek segítségével a colicin E7 fehérje működését modellezzük, QM/MM módszer segítségével. Ez egy összetett számítógépes kémiai modellt jelent, ugyanis az ezres nagyságrendű számú atomot tartalmazó fehérjék modellezése nagy kihívás a számításos módszerek számára. A fehérje számunkra érdekes részét, az aktív központját kvantumkémiai szinten, DFT módszerrel kezeljük, míg az ezt körülvevő részt molekulamechanikai modellel írjuk le. Kötéstávolságok lépésenkénti változtatásával modellezünk többféle reakcióutat, hogy a potenciális energiaprofilok meghatározása segítségével kiválaszthassuk, ezek közül melyiken játszódik le legnagyobb valószínűséggel a reakció. 2013. április
Hallgatóink sikeresen mutatták be előadásaikat a XXXI. OTDK Kémiai és Vegyipari Szekciójában, az Eszterházy Károly Főiskolán, Egerben. Gratulálunk! Balogh Ria Katalin: A CueR fémszabályzó fehérje és variánsainak előállítása, valamint kölcsönhatása "szoft" fémionokkal Borsos Katalin, Tóth Eszter: pH-függő koordinációs szféra fluktuáció a réz(II) - 5-fluor-szalicilsav - 2,6-bisz- hidroximetilpiridin terner rendszerben Csipak Brigitta: Cinkujj fehérjék tervezése, előállítása és tulajdonságaik vizsgálata Kozmér Zsuzsanna: Vizes oldatok Hg(II)-ion koncentrációjának meghatározására alkalmazható fluoreszcencián alapuló módszer kidolgozása Krekuska Hajnalka: A DNS kölcsönhatása potenciális gyógyszermolekulákkal, valamint azok réz(II) és cink(II) komplexeivel Schilli Gabriella Krisztina: Az N-ColE7 metallonukleáz mutánsainak sejtmérgező sajátsága Szekeres Levente István: Tiolcsoportokat tartalmazó vegyületek kölcsönhatása arzénessavval2013. március
Bécsi együttműködő partnereink segítségével cinkujjnukleázok részeit összekötő linkerek számítógépes tervezésével foglalkozunk. Az AÖU pályázat részeként Chris Oostenbrink (Bécs, BOKU) ellátogatott egyetemünkre, és előadást tartott a fehérjék számítógépes modellezéséről Biomolecular simulations on Cytochrome P450 enzymes címmel. A három napos megbeszélés során a linkertervezés részletei kerültek tárgyalásra, ami Németh Eszter egy hónapos bécsi tanulmányútja során folytatódik. Enellett Jaroslav Sebestik (IOCB, Prága) egy hónapot töltött el laboratóriumunkban, az itt alkalmazott molekuláris biológiai módszerek megismerése céljából.2013 . február
A HNH motívum vizsgálatával kapcsolatos cikkünk megjelent a Protein Expression and Purification folyóiratban.
2013. február
Két BSc hallgató töltött el egy hónapot Dániában, Campus Hungary pályázat nyerteseként. Eredményes kísérleti munkájuk BSc szakdolgozatukban lesz bemutatva. Balogh Ria a Dán Technikai Egyetemen (DTU, Lyngby), Hans E. M. Christensen laboratóriumában dolgozott, ahol a CueR fehérje kifejezésével és kromatográfiás tisztításával foglalkozott. Borsos Katalin a colicin E7 fehérje rövidített mutánsát vizsgálta CD- és LD- spektroszkópia segítségével a Koppenhágai Egyetemen, Peter W. Thulstrup irányítása mellett.2013. február
Zóka István PhD hallgató három hónapot töltött el a Tsukubai Egyetemen, Kyosuke Nagata laboratóriumában. Mesterséges cinkujj-nukleázok génjének előállításával, és a fehérjék kifejezésével, tisztításával foglalkozott. A sok munka mellett jutott egy kis idő a japán kultúra megismerésére is. 2013 január
Elfogadták publikációnkat a Journal of Biological Inorganic Chemistry című folyóiratban.
2012. január
Németh Eszter PhD hallgató egy dániai tanulmányút keretében a colicin E7 fehérje mutánsainak kifejezésével, tisztításával és spektroszkópiai vizsgálatával foglalkozott. A fehérjék kifejezése, tisztítása és tömegspektrometriás jellemzése a Dán Technikai Egyetemen, Hans E. M. Christensen laboratóriumában történt. A fehérjék DNS-sel való kölcsönhatásának és reakciójának vizsgálata is megkezdődött együttműködésben Peter W. Thulstruppal, elsősorban lineáris dikroizmus segítségével.
2012. december
Szunyogh Dániel 6 napra Svájcba utazott, hogy Genfben, a CERN-kutatóközpontban végezzen PhD munkájához kapcsolódó méréseket. A tavasszal előállított dodekapeptid perturbált gamma-gamma szögkorrelációs spektroszkópiával történő vizsgálatát végezte. 199-es metastabilis Hg(II) jelenlétében a kialakult komplexek geometriáját figyelte meg.2012. október
Czene Anikó három hetet töltött Dániában, Hans E. M. Christensen laboratóriumában. PhD munkája részeként a colicin E7 nukleáz domén egyik rövidített mutánsát tisztította és vizsgálta tömegspektrometria segítségével.2012. augusztus
Gyurcsik Béla két hónapot töltött Japánban, Kyosuke Nagata laboratóriumában, a Tsukubai Egyetemen.2012. július
Szunyogh Dániel egy hónapot töltött Genfben, a CERN-kutatóközpontban, hogy egy új technika, az ún. beta- NMR alkalmazásába nyerhessen betekintést. A Beta-NMR spektroszkópia igen ismert eljárás biofizikusok körében különböző biológiai minták szerkezetének/fémionokkal történő kölcsönhatásának egykristályból történő meghatározásához. Nagy vákuum használata eddig lehetetlenné tette folyadékminták vizsgálatát, azonban 2012 nyarán egy nemzetközi kutatócsoport több hónapos munkájának gyümölcseként sikeres Beta- NMR spektrumfelvételek történtek folyadékfázisból, mely rendkívül ígéretes a biomolekulák fémionokkal történő kölcsönhatásának vizsgálata szempontjából. Bővebb információ: http://cds.cern.ch/record/14756702012. szeptember
Tóth Eszter MSc hallgató 5 éves PhD ösztöndíjat nyert el Japánban, a Tsukubai Egyetemen. Kalandjairól blogjában lehet olvasni: http://esztianagyvilagban.blogspot.hu2012. június
Szunyogh Dániel egy hónapot töltött el Dániában, a Koppenhágai Egyetemen. A V. Cholerae baktérium által termelt CueR fémionszabályzó fehérjében található fémionkötő szekvenciájának modellezés már kora tavasszal az SZTE-n megkezdődött, a 12 aminosavból álló peptid szintézisét követően HPLC-vel történő tisztítás következett. Ezt követően a nyersanyagot a koppenhágai egyetemen egy ill. kétértékű fémionokkal (Ag(I), Hg(II), Zn(II), Pb(II)) vizsgálta 1H-NMR spektroszkópiával. Arra kereste a választ, hogy vajon az egyes fémionoknak milyen szerkezetalakító hatása van, ha a ligandum mellett különböző koncentrációkban vannak jelen.