Kurzus Bevezetés a biofizikai kémiába Kód K333
Szak (szabadon választható szakmai /C/ kurzus) Kredit 2
Felelős oktató dr. Körtvélyesi Tamás
egyetemi docens
Számonkérés K5 vagy K3
Létszámkorlát 25
Típus elődás Heti óraszám 2 Periódus őszi félév Javasolt félév 6-10.
Előfeltétel K035 kredit
Teljesítés feltétele -
Helyettesítő tárgy -
 
Tematika:

    A Fizikai Kemia I-III. Alapkurzusok anyagara építve a fizikai kémia biolóiai vonatkozású válogatott fejezeteinek ismertetése.
    A biofizikai kémia néhány központi kérdése. Alapvető módszerek a biofizikai kémiában.
    Molekuláris kölcsönhatások makromolekulás szerkezetekben.A víz szerkezete a makromolekulás szerkezetek szomszédságában. Kis molekulák kötődése makromolekulára es ennek kvantitativ jellemzése. Kötődés nukleinsavakra.
    Ligandum kölcsönhatások egyensúlyban.
    Ligandum kolcsönhatások kinetikája. Enzim reakciók pH függése. Az enzimreakciok molekuláris szintű értelmezése. Relaxácios módszerek és gyorskinetikai módszerek alkalmazása. Konformácios átmenetek termodinamikai kezelése. "Folding" probléma kinetikai kezelése.
    Proteinek szerkezete. Elsődleges, másodlagos, harmadlagos és negyedrendű szerkezetek. Proteinek térfogata. Szerkezeti es funkcionális hasonlóág. Ionizációs egyensúly proteinekben. Oldalláncok polaritása. A szerkezet dinamikus es sztatikus jellege. Az oldószer hatása a protein molekulára. Az oldószer-protein kölcsönhatás termodinamikája. A kölcsönhatási erők modellezése. Proteinek molekuláris dinamikájának alapjai. Protein szerkezet megjóslása - homológia modellezés.
    Nukleinsavak elsődleges, másodlagos, harmadlagos es negyedrendű szerkezete. A szerkezetet stabilizáló erők és modellezésük. A "stacking" hatása a szerkezetre. Az oldószer hatása a szerkezetre. Kis molekulák kötődése nuklein savakra.
    Protein-protein kölcsönhatás. Protein-lipid kölcsönhatás. Membránproteinek es jellemzőik. Protein - kis molekulák kölcsönhatása. A kölcsönhatás modellezése dokkolási eljárásokkal.

Irodalom:

  1. C.R.Cantor, P.R. Schimmel: Biophysical Chemistry, 1-3., W.H.Freeman and Company, San Francisco, 1995.
  2. K. E. van Holde, C. Johnson, P. Shing Ho: Principles of Physical Biochemistry, Prentice Hall, Upper Saddle River, New Jersey 07458, 1998.